泛基因组进而可以分为,核心基因和非核心基因。核心基因是指在所有动植物品系或者菌株中都存在的基因;非核心基因是指在1个以及1个以上的动植物品系或者菌株中存在的基因。通过分析核心基因和非核心基因的基本情况,并从特有基因序列的角度来研究物种内的差异。
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