泛基因组测序

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泛基因组研究,探秘物种间潜在密码

泛基因组包括核心基因组(Core genome)和非必须基因组(Dispensable genome)。 其中,核心基因组由所有样本中都存在的序列组成, 一般与物种生物学功能和主要表型特征相关,反映了物种的稳定性; 非必须基因组由仅在单个样本或部分样本中存在的序列组成,一般与物种对特定环境的适应性或特有的生物学 特征相关,反映了物种的特性。针对不同但又相互关联的个体材料进行较高深度测序, 单独进行组装,构建泛基因组图谱,以期获得该物种完整的遗传信息。

因材而为,挖掘品种特异性

选择不同亚种的材料:可以研究物种的起源及演化等重要生物学问题; 选择野生种和栽培种等不同特性的种质资源:可以发掘重要性状相关的基因资源,为科学育种提供指导; 选择不同生态地理类型的种质资源(不同世系):可以开展物种的适应性进化,外来物种入侵性等热门科学问题的 研究,为分子生态学等学科提供新的研究手段。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析, 每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。


信息分析

泛基因组测序是对多个物种进行低/高深度的测序、组装和注释, 通过构建泛基因组图谱,可得到这个物种的全部基因。同时还可 对多个品种进行比较分析,挖掘品种特有的基因以及变异位点,这 些变异位点以及特有基因往往与物种特有的生物学功能有关。



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