ATAC-seq

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ATAC-seq ⸺ 研究开放染色质的高通量测序技术

ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing)是一种利用高通量测序对转座酶易接近核染色质进行分析的方法。通过高活性的 Tn5 转座酶将测序接头插入染色质的开放区域,然后通过测序数据来推断染色质区域的可及性,并计算转录因子结合位点和核小体的区域位置。

周期短、范围广、特异性强

理论上至少利用500个细胞就可以快速的得到调控的多维信息,比同类产品节省大约3到5个数量级的细胞;通过 Tn5 转座酶在切割 DNA 时加入接头序列,经过 PCR 扩增即可获得测序文库,该过程数小时内即可完成;可以获得染色体在某个特定的时空条件下所有开放染色质区域,并不仅仅局限于某个转录因子的结合位点,或者某个特定的组蛋白修饰区域。具有“周期短、范围广、特异性强”的优势,已广泛应用于人、小鼠、猪、鸡、牛、扇贝、拟南芥等物种的研究。支持上门服务。


科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。


信息分析

开泰生物 ATAC-seq 项目通过 转座酶对特定时空开放的核染 色质区域进行切割,获得该时 空下全基因组中所有活跃转录 的调控序列信息,分析转录因 子结合信息、核小体区域信 息、转录调控元件分布等。



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