FFPE定量蛋白质组学

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简介

福尔马林固定的石蜡包埋(formalin-fixedparaffin-embedded,FFPE)组织样本长期以来被用于组织学和形态学结构的保存,以便对疾病进行组织病理学诊断。这些 FFPE 组织集合连同附加的临床和结果信息,形成了用于癌症和其他疾病研究的组织样本的宝贵资源。

研究意义

基于质谱的蛋白质组学为高通量分析成千上万的蛋白质提供了可能,因此,将标准蛋白质组学分析技术应用于 FFPE 组织蛋白提取液,将揭示大量与疾病相关的功能信息,从而帮助我们识别与特定疾病诊断、预后、监测和治疗相关的有意义的生物标志物。

技术难点

对组织进行甲醛固定及石蜡包埋等处理会导致组织细胞中的蛋白质、核酸等分子发生相当广泛的分子交联,使获取 FFPE 组织内锁定的蛋白质组变得相当困难。甲醛固定限制了蛋白质的提取效率,损害了免疫反应活性,并可能导致质谱技术对蛋白质的鉴定不明确。因此,需要一种有效的方法从 FFPE 组织中进行蛋白质的提取。基于此,诺禾致源经过大量文献调研、研发测试,现已开发出能高质量获取 FFPE 样本中蛋白质的提取方法。


参考文献

Fabian Coscia, Ernst Lengyel, Jaikumar Duraiswamy, et al. Multi-level Proteomics Identifies CT45 as a Chemosensitivity Mediator and Immunotherapy Target in Ovarian Cancer[J]. Cell, 2019, 179: 1-15.


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